通風(fēng)柜的排風(fēng)系統(tǒng)可分為集中式和分散式兩種。集中式是把一層樓面或幾層樓面的的通風(fēng)柜組成一個系統(tǒng)，或者整個實驗樓分成一二個系統(tǒng)。它的特點是通風(fēng)機少，設(shè)備投資小，而且對通風(fēng)柜的數(shù)量稍有增減，以及位置的變更，都具有一定的適應(yīng)性。然而由于系統(tǒng)較大，風(fēng)量不易平衡，盡管每個通風(fēng)柜上都裝有調(diào)節(jié)閥，但使用不方便，并且也不容易達到預(yù)定的效果。如果系統(tǒng)風(fēng)管損壞需要檢修時，那么整個系統(tǒng)的通風(fēng)柜就無法使用。所以，原來采用集中式系統(tǒng)的實驗室，先后都改為用分散式系統(tǒng)。分散式是把一個通風(fēng)柜或同房間的幾個通風(fēng)柜組成一個排風(fēng)系統(tǒng)。他的特點是：可根據(jù)通風(fēng)柜的工作需要來啟閉通風(fēng)機，相互不受干擾，容易達到預(yù)定的效果，而且比集中式節(jié)省能源，因為集中式系統(tǒng)，只要一個通風(fēng)柜在使用，就得開動大通風(fēng)機。分散式由于系統(tǒng)小，排風(fēng)量也小，阻力也小，所以通風(fēng)機的風(fēng)量、風(fēng)壓都不大，躁聲與振動相應(yīng)也較小。分散式還有一個特點，是對排出不同性質(zhì)的有害氣體易于處理。缺點是通風(fēng)機的數(shù)量多、系統(tǒng)多，如果通風(fēng)機集中于通風(fēng)機房內(nèi)，那么投資就會增大，如果通風(fēng)機分散布置，而且就地安裝，雖然通風(fēng)機的投資增加，但風(fēng)管的投資可節(jié)省，后總投資不一定增大。建議使用分散式。

在劃分系統(tǒng)時，同一個房間內(nèi)如有兩個以上的通風(fēng)柜，應(yīng)劃為一個系統(tǒng)，避免一個通風(fēng)柜在使用，其他的通風(fēng)柜產(chǎn)生倒流，使室內(nèi)受到污染。同樣，一個房間內(nèi)除了一個排風(fēng)系統(tǒng)外，不宜再裝置其他排風(fēng)通風(fēng)設(shè)備。

排風(fēng)系統(tǒng)的通風(fēng)機，一般都裝在屋頂上，或頂層的通風(fēng)機房內(nèi)，這樣可不占用使用面積，而且使室內(nèi)的排風(fēng)管道處于負(fù)壓狀態(tài)，以免有害物質(zhì)由于管道的腐蝕或損壞，以及由于管道不嚴(yán)密而滲入室內(nèi)，此外，通風(fēng)機安裝在屋頂上或頂層的通風(fēng)機房內(nèi)，檢修方便，易于消聲或減振。

排風(fēng)系統(tǒng)有害物質(zhì)排放高度應(yīng)按現(xiàn)行的《工業(yè)企業(yè)設(shè)計衛(wèi)生標(biāo)準(zhǔn)》和《工業(yè)三廢排放標(biāo)準(zhǔn)》執(zhí)行。在一般情況下，如果附近五十米以內(nèi)沒有較高建筑物時，排放高度應(yīng)超過建筑物處兩米以上。